روش کار سیفون بسیار ساده است . با توجه به سطح آب داخل سیفون در حالت عادی و قبل از تخلیه فاضلاب به داخل آن در سطح یکسان قرار میگیرد . پس از تخلیه فاضلاب وسایل بهداشتی ، توالت ، حمام در داخل سیفون ارتفاع آب در شاخه B به تدریج زیاد میشود و ارتفاع آب در شاخه c نیز به طور همزمان بالا میآید تا زمانی که سطح آب و فاضلاب به سر ریز لوله خروجی سیفون ها یعنی به سطح D برسد و در آنجا تخلیه شود . از این لحظه به بعد هر چه آب وارد لوله ورودی سیفون بشود از لوله خروجی آن خارج میگردد .